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shRNA表达克隆

根据结构来预测未知酶功能的新方法

Sep 04, 2007 No Comments


    Johannes Hermann等人采用一种变通的分子对接方法(即一种用来寻找潜在药物的计算机辅助的模拟方法),设计出一种根据结构来预测某种具有未知活性的酶的功能的方法。

       极端嗜热的海栖热袍菌(Thermotoga maritima)能产生一种酶(Tm0936),本试验就采用这种酶进行相关研究。在对接实验预测中,它将令5-甲硫腺苷(5-methylthioadenosine)和S-腺苷同型半胱氨酸(S-adenosylhomocysteine)去胺化,这一特性已通过化学方法和与一个反应产物相结合的该蛋白的X-射线晶体结构来证实。这种酶没有与已知的腺苷胺化酶具有相似的明显序列,甚至它所参与的通道似乎也是新颖的。如果这一新方法也适用于其他酶,那么它应当成为一种有力工具,来确定关键的酶在体内是如何发挥作用。

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